(1)染色镜检：将疣状物作组织切片或生殖道局部粘液涂片，用帕尼科拉染剂染色后，光镜下观察到特征性空泡细胞或角化不良细胞和角化过度细胞，可初步诊断为人类乳头瘤病毒。
(2)检测 HPV 脱氧核糖核酸：根据不同标本采用点杂交或原位杂交检测HPV脱氧核糖核酸。亦可选择适当的特异序列，合成引物做聚合酶链式反应后进行杂交，聚合酶链式反应具有敏感，特异及可选择不同类型的引物扩增后分型等优点。
(3)血清学试验：应用重组技术表达抗原检测患者血清中IgG 抗体。或抗原免疫动物制备免疫血清或单克隆抗体检测组织或局部粘液中人类乳头瘤病毒抗 原。
(4)组织化学检查：取少量病损组织制成涂片，用特异抗人类乳头瘤病毒的 抗体作染色。如病损中有病毒抗原，则抗原抗体结合。在过氧化物酶抗过氧化物 酶方法中，核可被染成红色。此法特异性强且较迅速，对诊断有帮助。
(5)免疫组织学检查：常用过氧化物酶抗过氧化物酶方法，显示湿疣内的病 毒蛋白，以证明疣损害中有病毒抗原。人类乳头瘤病毒蛋白阳性时，尖锐湿疣的浅表上皮细胞内可出现淡红色的弱阳性反应。
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