P53基因是迄今为止发现的与人类肿瘤相关性最高的基因，定位于染色体17p13，全长20kb，由11个外显子组成，编码一种核磷酸蛋白，调节转录，主要功能是调节细胞周期停滞和促进有DNA损害的细胞凋亡。当在理化因素作用下细胞DNA发生损伤时，p53基因使细胞分裂停止在G1~S，阻止细胞进入S期，使细胞修复损伤、恢复正常，被称为“基因卫士”。而突变的p53产物使细胞生长增殖失控，有DNA破坏的细胞继续分裂而发生肿瘤性转化。

　　

　　一些研究提示，HPV E6蛋白可通过与p53基因的互相作用使正常细胞发生转化。高危型HPV E6蛋白与野生型p53具有高度亲和性，两者极易结合使p53快速降解，可使野生p53基因的抑制作用丧失，从而启动细胞周期，抑制细胞凋亡，使细胞过度增殖而导致肿瘤的发生。改变了的p53，其抑癌功能丧失，而产生促进增生的能力。