 中医治疗主要是辨证论治，根据不同的患者体质，给予清热解毒、除湿消疣的药物进行治疗。
（1）湿热之体 由于素喜肥甘厚味，嗜好烟酒，湿热内蕴下注皮肤粘膜，使前后二阴局部潮湿，蕴久成毒，发为尖锐湿疣。
（2）外染毒邪 多由于不洁性交，感染湿浊毒邪，发为尖锐湿疣。
中医根据患者的体质和疣体的大小，结合全身症状，常划分为3型论治。它们是湿热下注证、外染毒邪证和气血瘀滞证。湿热下注证常发生于素体肥胖，阴部潮湿的患者；外染毒邪证常发生于不洁性交的患者；而气血瘀滞证主要见于湿疣日久，疣体灰暗的患者。
湿热下注证或有肛周皮损潮湿红润，或有包皮过长，或有白带过多或其他皮肤病。常伴口苦、口粘、口渴不喜饮水，大便粘滞不畅，小便黄。舌红苔黄腻，脉弦数。这是由于肝胆湿热下注，循经流注阴部所致。治疗宜清利湿热，解毒消疣。
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